TAK THOG這個地方以前只有一個蓮師在8世紀曾閉關修行三年的山洞，16世紀時成就者蓮花事業在山洞上建了關房，後來一位名叫貢嘎朋措的喇嘛將巖洞修建成我們現在所見的寺廟大殿。
蓮師洞面積約20平方米大小，人站裡面伸手可觸及洞頂，因此得名TAK（岩石）THOG（頂）——「巖頂寺」。寺廟僧人介紹，這裡冬暖夏涼溫度宜人，是一個適合禪修的阿蘭若處所。
因年代久遠，洞壁四周均被長年點燃的酥油燈所熏黑，上面的蓮師八變壁畫已難以辨認。仁波切以他的經驗告訴大家：用糌粑粉塗抹在壁畫上，可以將上面的油垢吸附乾淨且不破壞原本的畫面。這恢復壁畫的訣竅，是否如我們被無明習氣所染污遮蓋的真如自性，需要值遇明師善知識、依理如法聞思修，才能夠再度彰顯的道理一樣？
洞中供奉著一尊千手千眼觀世音菩薩，佛龕裡的佛像是多傑扎波（金剛忿怒力），旁邊掛著的唐卡皈依境主尊同樣是立姿蓮師金剛忿怒力，這都屬於北伏藏的教法。
仁波切帶領大家共修蓮師七句祈請文及禪修。
蓮師本命年，能夠與上師及金剛師兄弟在此聖地共修，實屬機會難得且緣起殊勝，共修結束上師領眾迴向：以此禪坐以及誦修之功德，願我等一切眾生速證蓮花生大士之果位，一切眾生盡無餘，悉皆安置彼剎土。
西藏的佛法是由藏王赤松德貞迎請蓮花生大士和堪布寂護入藏後建立。新大殿所立的“師君三尊”像：藏王赤松德貞、蓮師和堪布寂護。
巖頂寺除了有蓮師洞和新大殿外，還有藏經閣殿（甘珠兒拉康）和鄔金頗章殿。在這兩個舊殿裡有外內密的蓮師像，以及繪有大自在天、羅睺羅、噉食金剛護法等男女眾護法的古舊壁畫，這些都是這個拉達克地區唯一的寧瑪派寺院——巖頂寺的獨特之處。
